• 伊邪那岐大神（イザナギノオオカミ）
• 火産霊神（ホムスビノカミ）
• 大山津見神（オオヤマヅミノカミ）

建仁元年肥後守平信基公（平清盛三代孫行盛の子）は、北条時政の執奏により種子島以下南海十二島の領主となられ、鎌倉より御下向の事となった。海上越えの遠い御出立であったので、従臣久木原某は海上無難・国家安寧を祈願して神明の霊（一つの玉石）を捧持し、恙なく任務を果した。この神恩に報いるため、島内で祀るに相応しい霊地として郡原を定め、里の氏神として鎮め祀った。

尚、御祭神は伊邪那岐大神・火産霊神・大山津見神の三柱とする。